Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Thumpd1Q99J36 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Thumpd1Q99J36 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms