Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Letmd1Q924L1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Letmd1Q924L1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Letmd1Q924L1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Letmd1Q924L1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Letmd1Q924L1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Letmd1Q924L1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Letmd1Q924L1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Letmd1Q924L1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Letmd1Q924L1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Letmd1Q924L1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Letmd1Q924L1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Letmd1Q924L1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Letmd1Q924L1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Letmd1Q924L1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Letmd1Q924L1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Letmd1Q924L1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Letmd1Q924L1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Letmd1Q924L1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Letmd1Q924L1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Letmd1Q924L1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms