Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim7Q923T7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim7Q923T7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms