Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubb6Q922F4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubb6Q922F4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb6Q922F4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms