Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SncbQ91ZZ3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms