Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rrp1bQ91YK2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrp1bQ91YK2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp1bQ91YK2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.7 ms