Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps36Q91XD6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps36Q91XD6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms