Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI47

Abcc2, Canalicular multispecific organic anion transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc2Q8VI47 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Abcc2Q8VI47 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Abcc2Q8VI47 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Abcc2Q8VI47 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Abcc2Q8VI47 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Abcc2Q8VI47 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Abcc2Q8VI47 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Abcc2Q8VI47 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Abcc2Q8VI47 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Abcc2Q8VI47 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Abcc2Q8VI47 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc2Q8VI47 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc2Q8VI47 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc2Q8VI47 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc2Q8VI47 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc2Q8VI47 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc2Q8VI47 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms