Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDD8

Washc1, WASH complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc1Q8VDD8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Washc1Q8VDD8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Washc1Q8VDD8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.1 ms