Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ6

Sgsm3, Small G protein signaling modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgsm3Q8VCZ6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgsm3Q8VCZ6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgsm3Q8VCZ6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms