Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubxn4Q8VCH8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn4Q8VCH8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms