Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm4cQ8VCD7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kdm4cQ8VCD7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kdm4cQ8VCD7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms