Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms