Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Hecw1Q8K4P8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Hecw1Q8K4P8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Hecw1Q8K4P8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Hecw1Q8K4P8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms