Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trappc12Q8K2L8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc12Q8K2L8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms