Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIB5

Fermt2, Fermitin family homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt2Q8CIB5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fermt2Q8CIB5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fermt2Q8CIB5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fermt2Q8CIB5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms