Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI7

Polr2b, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2bQ8CFI7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2bQ8CFI7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2bQ8CFI7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms