Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hpf1Q8CFE2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Hpf1Q8CFE2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Hpf1Q8CFE2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Hpf1Q8CFE2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hpf1Q8CFE2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
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Hpf1Q8CFE2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Hpf1Q8CFE2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.2 ms