Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf17Q8CFA7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf17Q8CFA7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf17Q8CFA7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf17Q8CFA7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf17Q8CFA7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf17Q8CFA7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf17Q8CFA7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf17Q8CFA7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf17Q8CFA7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf17Q8CFA7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf17Q8CFA7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf17Q8CFA7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf17Q8CFA7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf17Q8CFA7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf17Q8CFA7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf17Q8CFA7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf17Q8CFA7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms