Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc178Q8CDV0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms