Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CrebrfQ8CDG5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CrebrfQ8CDG5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CrebrfQ8CDG5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CrebrfQ8CDG5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CrebrfQ8CDG5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms