Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms