Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrn3Q8CBC6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrn3Q8CBC6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn3Q8CBC6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms