Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef5Q8C0Q9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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Rapgef5Q8C0Q9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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Rapgef5Q8C0Q9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rapgef5Q8C0Q9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef5Q8C0Q9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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