Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp5Q8BX09 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp5Q8BX09 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp5Q8BX09 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms