Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctdsp2Q8BX07 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctdsp2Q8BX07 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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