Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm4aQ8BW72 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm4aQ8BW72 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms