Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp38Q8BW70 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp38Q8BW70 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp38Q8BW70 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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