Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PcgF3Q8BTQ0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms