Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gga3Q8BMI3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gga3Q8BMI3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms