Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmd4aQ8BIE6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd4aQ8BIE6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd4aQ8BIE6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms