Protein–RNA interactions for Protein: Q80YA8

Crb2, Protein crumbs homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb2Q80YA8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Crb2Q80YA8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Crb2Q80YA8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crb2Q80YA8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms