Protein–RNA interactions for Protein: Q80X53

Ccdc116, Coiled-coil domain-containing protein 116, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc116Q80X53 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc116Q80X53 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc116Q80X53 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc116Q80X53 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc116Q80X53 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc116Q80X53 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc116Q80X53 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc116Q80X53 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc116Q80X53 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc116Q80X53 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc116Q80X53 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc116Q80X53 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc116Q80X53 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc116Q80X53 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc116Q80X53 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc116Q80X53 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc116Q80X53 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc116Q80X53 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc116Q80X53 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc116Q80X53 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc116Q80X53 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc116Q80X53 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc116Q80X53 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc116Q80X53 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc116Q80X53 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc116Q80X53 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc116Q80X53 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc116Q80X53 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc116Q80X53 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc116Q80X53 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc116Q80X53 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc116Q80X53 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc116Q80X53 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc116Q80X53 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc116Q80X53 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc116Q80X53 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms