Protein–RNA interactions for Protein: Q80TA6

Mtmr12, Myotubularin-related protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr12Q80TA6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Mtmr12Q80TA6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mtmr12Q80TA6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr12Q80TA6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms