Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmc3Q7TQ69 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms