Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp397Q7TNK4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp397Q7TNK4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms