Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Uhrf2Q7TMI3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uhrf2Q7TMI3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf2Q7TMI3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms