Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sys1Q78S06 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms