Protein–RNA interactions for Protein: Q78PG9

Ccdc25, Coiled-coil domain-containing protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc25Q78PG9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc25Q78PG9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc25Q78PG9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc25Q78PG9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc25Q78PG9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc25Q78PG9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc25Q78PG9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc25Q78PG9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc25Q78PG9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc25Q78PG9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc25Q78PG9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc25Q78PG9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc25Q78PG9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc25Q78PG9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc25Q78PG9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc25Q78PG9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc25Q78PG9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc25Q78PG9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc25Q78PG9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc25Q78PG9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc25Q78PG9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc25Q78PG9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc25Q78PG9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc25Q78PG9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc25Q78PG9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc25Q78PG9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc25Q78PG9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc25Q78PG9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc25Q78PG9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc25Q78PG9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc25Q78PG9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc25Q78PG9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc25Q78PG9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc25Q78PG9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc25Q78PG9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc25Q78PG9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc25Q78PG9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms