Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stambpl1Q76N33 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Stambpl1Q76N33 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stambpl1Q76N33 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stambpl1Q76N33 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stambpl1Q76N33 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stambpl1Q76N33 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stambpl1Q76N33 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stambpl1Q76N33 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 377.3 ms