Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mindy1Q76LS9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mindy1Q76LS9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mindy1Q76LS9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mindy1Q76LS9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mindy1Q76LS9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mindy1Q76LS9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mindy1Q76LS9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mindy1Q76LS9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mindy1Q76LS9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mindy1Q76LS9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Mindy1Q76LS9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mindy1Q76LS9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mindy1Q76LS9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mindy1Q76LS9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mindy1Q76LS9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms