Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sned1Q70E20 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sned1Q70E20 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms