Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpv1Q704Y3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpv1Q704Y3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpv1Q704Y3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms