Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Topbp1Q6ZQF0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Topbp1Q6ZQF0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Topbp1Q6ZQF0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Topbp1Q6ZQF0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms