Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube2oQ6ZPJ3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2oQ6ZPJ3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms