Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPF4

Fmnl3, Formin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmnl3Q6ZPF4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fmnl3Q6ZPF4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fmnl3Q6ZPF4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fmnl3Q6ZPF4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms