Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc44a1Q6X893 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms