Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt9Q6RHW0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt9Q6RHW0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt9Q6RHW0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms