Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp2b4Q6Q477 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2b4Q6Q477 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms