Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rrm2bQ6PEE3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rrm2bQ6PEE3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrm2bQ6PEE3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrm2bQ6PEE3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms